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Diamond 5—晶體結構可視化軟件
Diamond是一款在原子水平實現晶體結構可視化的化學專業軟件。它自開發至今，經歷了1.0、2.0、3.0、4.0 等幾代產品，其功能在不斷完善。利用該軟件不僅能創建晶體模型，還能以各種形式（線狀，球棍狀或空間堆積狀，多面體形式等）展示晶體模型，而且模型可以根據用戶的需要自由旋轉、移動和縮放，可以用著色方案對原子進行強調和渲染，也可以對晶體模型進行文字標注。
如果你有晶體結構數據（空間群參數，單胞參數，原子參數或者晶體數據文保持高度件，如Cif文件，）而且你希望繪制用于演示文稿或者出版物的高質量圖片； 了解晶體結構的構造原理；通過各種方式向客戶展現晶體構造原理，那么Diamond軟件都可以幫你做到。
英文詳細介紹：
Crystal and Molecular Structure Visualization
Diamond is our outstanding molecular and crystal structure visualization software. It integrates a multitude of functions, which overcome the work with crystal structure data - in research and education as well as for publications and presentations.
Diamond does not only draw nice pictures of molecular and crystal structures like most of its competitive programs do. It offers an extensive set of functions that let you easily model any arbitrary portion of a crystal structure from a basic set of structural parameters (cell, space group, atomic positions).
With its high data capacity, its wide range of functions beginning with the generation of molecules reaching up to the construction of rather complicated inorganic structural frameworks, Diamond is a comprehensive tool for both molecular and solid state chemists as well as for surface and material scientists.
Diamond函數列表
?32位Windows應用程序有多文檔界面（MDI）、面向對象的菜單、工具欄和本地彈出菜單。允許“simultaneous”多重結構的處理。
輸入和輸出:
?3 / 4Diamond專有二進制文件格式（擴展名：diamdoc）：
●同時支持晶體和分子結構(即有或沒有平移對稱)。
●在文檔中存儲多個結構的數據集，每個都有:
?原子參數，
?細胞參數和空間群(可選)，
?各向異性位移參數，
?連接參數(鍵，氫鍵，非鍵合的接觸)
?化學和書目數據(作者、參考、數據庫起源等)。
●支持多個結構數據集結構圖片。保存你自己的內置和設計的框架的晶體結構。
●兼容Diamond 2格式(DSF)。
?原子，鍵數、多面體等數量僅受限于內存。
?手動輸入或更新的化學、晶體和書目數據。
?從數據格式自動導入:
●用ICSD或CRYSTMET創建下載格式CRYSTIN
●劍橋結構數據庫FDAT格式。
●布魯克海文蛋白質數據庫格式。
●SHELX-93格式。
●晶體信息文件(CIF)。
●XYZ格式(具有直角坐標的自由格式)，
●SYBYL MOL 和 MOL2格式，
●Cerius2(CSSR)格式，
●MDL MOL格式。
?出口結構數據:
●CIF，
●SCHAKAL，
●XYZ格式。
?POV-Ray助理創建的場景在紋理，陰影，反射，背景圖片等方面擁有照片般逼真的效果。
?VRML結構圖的3D世界輸出
?2D圖形結構圖的輸出（用于后處理例如在文字處理器或圖形應用程序）：
●如Windows圖元文件（WMF，矢量化）
●如位圖（BMP；寬度、高度和分辨率的定義）
●如GIF、JPG和PNG文件，例如HTML的文檔鏈接。
?在文檔（連同相關的結構圖片）之間剪切、復制或粘貼數據集。允許創建小的“數據庫”。
?搜索化學，晶體，或書目數據：
●在選定目錄中的選定類型的文件中
●“結晶學開放數據庫”（COD），包括（其中包括）amcsd（“美國礦物晶體結構數據庫”）以及從聯合會期刊的CIF文件，參見“ www.crystallography.net ”。
?文檔中的結構數據集的可配置列表：
●如表(“結構列表”)
●或以折疊的形式作為“結構信息欄”。
?在具有多個結構的文檔中區分結構數據集的顏色編碼。
?選定的數據集或整個文檔的結構圖片的縮略圖概述。
?最近的圖片列表縮略圖上編輯圖片/文件。
?用于全面或緊湊的結構數據的文本表示的數據表。
?“原子”名單：結構圖片中原子的層次列表，組的原子位置和/或基團或分子。
?打印選定的數據集、數據表、表或結構圖。通過用于后處理的窗口剪貼板的數據集的文本拷貝。
?數據表和表格數據導出為HTML。
建設:
?可選輔助，有助于創建一個結構圖片從頭開始或修改一個圖片。
?“Auto Picture Creator”——可在一個?？看翱诘膫榷伺c結構圖片-以交互方式改變圖片的建設以及圖片的設計和觀看方向。
?“Building schemes”(在Diamond 3中稱"Auto-Builder")自動創建圖片或根據用戶定義的策略。在可視化許多類似的結構時有用。
?“晶體”和“分子”結構之間的轉換，即細胞和對稱信息的添加或刪除。
?選擇中心原子的單位細胞，多個細胞，任何細胞范圍，或盒或球的填充。
?在屏幕內填充用戶定義的矩形區域。
?沿平面板填充（hkl或最小二乘）之間或平面坐標系統的墻。
?構建晶格原子的選擇（“過濾器”）。
?創作（討論）原子的環境中，可以從原子網站Dirichlet域。
?討論的連接輔助的直方圖顯示選定的原子類型和從鍵參數之間的距離的分布，連同自動計算和檢查的距離范圍。
?自動債券創造，基于連接，或手動插入的債券之間的兩原子。
?添加所有的原子（和可選的鍵，氫鍵，聯系人）原子的參數列表以及連接參數列表。
?從作為初始原子的參數列表中生成原子，用于建立復雜的框架。
?完成選定的原子周圍的配位球。
?“Pump up”：在選定的原子和它的反轉（“收縮”）的多個領域的一代。
?例如被夾在細胞邊緣的分子或片段的自動生成。
?分子單位的定義（從原子參數列表）。
?從分子單元在對稱等效位置的產生。
?在選定的原子或分子附近搜尋分子。
?分子填料（長方體、球體、創作板，或層）。
?“生長”和“切割”：聚合物或分子碎片的膨脹和還原。
?創建“斷開”債券信號無窮小的鏈，層，或3D框架?！皵嚅_”與正常債券之間的轉換。
?氫鍵和非鍵接觸連接定義。氫鍵和聯系人創建。
?擴展到鄰近的原子或分子通過氫鍵和/或聯系人建立分子簇和反轉（“減少”）。
?用鼠標滾輪討論接觸球和分子團簇的膨脹或減少。
?結構圖片之間的結構部分的剪切、復制和粘貼：
●結構圖片（或整個圖片）的一個片段可以被復制。
●復制的片段可以粘貼到一個空白或另一個相同的數據集的圖片。
?內置框架的用戶控制拆除。
?多步撤消和重做功能（帶圖片縮略圖）使安全試驗更高的復雜和未知的結構框架。
可視化:
?“設計方案”（一種樣式表），包含圖片設計和查看設置，快速，方便地應用到其他結構圖片。
?布局模式:
●正則/窗口，
●用于打印輸出，如A4頁面大小的白色背景，
●對于一個給定的x和y維度和DPI分辨率位圖創作。
?可變縮放因子（增強了“頁面視圖”模式的Diamond 2）
?模型，分配到全局或單獨對單個或多個原子（允許在一個和相同的圖片混合不同的模型）：
●球和棍(常規)
●橢球體
●空間填充
●棍棒或電線（取決于債券半徑）
?沿特殊軸或向特殊平面的視圖的定義。
?中央或平行投影，景深效果和立體顯示。
?真實感渲染模型定義的光源和材料特性（OpenGL）。
?原子團和鍵的顏色、樣式和半徑的變化。每一個單一的原子的個別設計是可能的。
?原子和鍵半徑隨鼠標滾輪的變化。
?ORTEP - like原子類型（橢圓廓）在平模和渲染。
?可選包和雙色鍵。
?原子和債券的標簽。用戶定義的文本，可以放置在任意位置的圖片。
?配位多面體生成：
●圍繞所選擇的組的中心原子或單個選擇的原子，
●從選定的配位體原子組合，
●任選地具有透明或半透明的表面。
?增強的配位多面體結構：
●定義的邊緣和角的選擇（點擊）原子和債券，RSP。
●刪除邊緣以增加三角形到更高的多邊形。
●同一個站點的原子之間的多面體建筑的復制和粘貼。
?（透明）晶格平面和（最佳）平面或線通過選定的原子的定義。
?向原子中加入載體來表示磁力矩。
?可視化的氧化數種顏色差異、場地占用等因素。
?全屏視圖(與窗框、菜單、工具欄隱藏)。
動畫:
?運動結構的圖片:
●模式:
?旋轉在x,y,或z軸，
?水平或垂直轉移在繪圖區域，
?放大倍數的變化(從Angstroems厘米)，
?相機距離的變化(角度的印象)。
●控制:
?鼠標(鼠標旋轉越快越快等等)，
?每擊鍵鍵盤(如旋轉1度)，
?數值通過對話框(輸入)。
●可選的“自旋”功能，即加速運動。
●連續的運動，它可以被打斷，繼續。
?“Grab”模式：鼠標光標在一個原子的軌跡球旋轉。用鼠標右鍵按下按鈕。用鼠標滾輪改變放大系數。
?Walk-through模式，使相機/觀眾瀏覽的結構圖片。
?錄音機，有助于創造的視頻序列，如AVI文件。
探索:
?鼠標光標下原子的鄰域預覽與鼠標滾輪的預覽球變量半徑。
?粉末圖樣計算：
●衍射參數變化：
?輻射類型:X-ray (laboratory, synchroton),neutron, electron,
?波長（wavelength,）
?LP修正（LP correction,）
?2θ范圍（2theta range,）
?可選配置功能。
●衍射圖(樣式、顏色和線量可以配置)。
●通過追蹤2θ范圍，反射參數表放大/縮小。
?距離和角度計算（包括標準的不確定性）：
●在一個可配置的表中，對于選擇的原子類型和一個相當大的距離范圍，
●當前在結構圖片中選擇的原子（s）。
●顏色編碼距離直方圖圖示距離。
?測量距離，角度和扭轉角度的交互（包括標準的不確定性）。
?擴展的幾何特征的測量（包括標準的不確定性）：
●兩平面之間的夾角（由HKL或者（最好）通過3個或多個原子平面），
●兩條線之間的夾角，
●平面與直線之間的夾角，
●從一個平面或一條線的原子的距離，
●一組原子的質心，
●一組原子平面或線性（組成原子平面/線的距離）。
?新的屬性窗格，顯示的信息:
●結構圖片的內容（有多少創造了原子，債券、多面體等），
●當前“公式求和”，這意味著與原子組相關的原子數，
●關于結構圖片中選擇的對象的信息或在“屬性”窗格上方的（可選）表中，例如參數列表中的原子的信息，
●當前選定對象的表，
●選擇原子（s）的距離，
●選定原子之間的距離，
●所選原子的中心（質心），
●對選定的原子和原子從平面或線偏差的平面或線性，RSP.，
●分配到參數列表中選定原子的原子表或選擇原子組，
●指定給選定的鍵組的鍵（即原子組對），
●配體的邊緣，面臨選擇的多面體的信息，
●一個選擇的原子網站Dirichlet domain 。
●鄰近的原子和一個選定的Voronoi多面體的頂點。
●安裝和運行Diamond Version 4.0 或更高，你應該有以下系統的要求：
●個人電腦與微軟的Windows XP，Windows Vista，Windows 7，Windows 8 / 8.1或Windows 10操作系統（注：不運行Windows RT）
●Microsoft Internet Explorer 8或更高
●Intel或AMD處理器（或兼容）與“x86”指令集
●1 GB內存
●3.8 GB可用硬盤空間（6 GB的安裝過程，對晶體學開放數據庫打開）
●圖形分辨率為1024×768像素的32768種顏色（“高顏色”）或更高（1280×800像素或更推薦）
●DVD-ROM驅動器（安裝DVD）
●微軟兼容鼠標
北京友萬信息科技有限公司，英文全稱：Beijing Uone Info&Tech Co.,Ltd ( Uone-Tech )是中國大陸領先的教育和科學軟件分銷商，已在中國300多所高校建立了可靠的分銷渠道。擁有最成功的教學資源和數據管理專家。如需申請軟件采購及老版本更新升級請聯系我們，咨詢熱線：010-56548231 ,咨詢郵箱：info@uone-tech.cn 感謝您的支持與關注。
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